云南是內陸省份，四周不臨海，但水量豐富，江河、湖泊、泉潭、冰川景觀奇特。在云南的土地上分布著大大小小的河流600多條，它們分別屬于長江（金沙江）、珠江（南盤江）、紅河（元江）、瀾滄江（湄公河）、怒江（薩爾溫江）、伊洛瓦底江六大水系，分別注入太平洋和印度洋。除珠江、紅河的源頭在云南境內外，其余均為過境江流。怒江、瀾滄江、紅河、瑞麗江（伊洛瓦底江水系）是國際河流，尤其瀾滄江流經老撾、緬甸、泰國、柬埔寨、越南等國家，因此被稱為“東方的多瑙河”。一個省內有六大水系分屬兩大洋，四條河流為國際河流，這在世界上都是極為罕見的。

云南還有數以百計的高原淡水湖泊，面積1平方公里以上的就有37個，是中國湖泊最多的省份之一。其中的許多湖泊馳名中外，被譽為“高原明珠”，例如滇池、陽宗海、撫仙湖、星云湖、杞麓湖、異龍湖、洱海、程海、瀘沽湖就打湖泊。這些湖泊多為斷層陷落的構造湖，往往四面環山，湖光山色相映成趣。而且水質清澈，即利于魚蝦繁殖，又利于調節氣候，可灌農田，可通舟楫，因而大多成為風景秀麗的游覽勝地。

云南泉水分布廣泛，僅溫泉就有1200多個，約占全國溫泉總數的1/3，居全國之冠。幾乎縣縣有溫泉，而且流量大，每年流出熱水約3.6億立方米，位居全國第二。這里有著名的“溫泉城”——昆明、“熱水城”——洱源、“地熱之鄉”——騰沖。